Hội thảo chia thành 3 phiên làm việc và 1 diễn đàn trao đổi, diễn ra theo hình thức trực tiếp kết hợp trực tuyến. Hội thảo gồm 24 báo cáo chuyên đề của hơn 30 nhà nghiên cứu trong nước và Nhật Bản. Xuyên suốt hội thảo là những tham luận, bài khảo cứu nghiêm túc, khoa học, phân tích và đánh giá về mối quan hệ giữa Việt Nam và Nhật Bản trong nhiều lĩnh vực: Lịch sử và giao lưu văn hóa, ngoại giao, an ninh - quốc phòng, kinh tế, tài trợ ODA, hợp tác giáo dục, nông nghiệp, chuyển đổi số, hợp tác vùng./.