Đây là lần đầu tiên lĩnh vực xác định xuất xứ hàng hóa có một đầu mối văn bản riêng, giúp hải quan và doanh nghiệp thuận tiện thực hiện và tra cứu cụ thể, thống nhất, minh bạch; tạo thuận lợi cho hoạt động xuất, nhập khẩu của doanh nghiệp; bảo vệ quyền lợi người tiêu dùng và áp dụng ưu đãi thuế quan theo đúng các cam kết quốc tế mà Việt Nam là thành viên. Với định hướng quan trọng là minh bạch hóa, Thông tư quy định cụ thể các trường hợp phải nộp chứng từ chứng nhận, các trường hợp không phải nộp chứng từ, các chứng từ khác phải nộp để chứng minh…Hàng hóa phải nộp chứng từ chứng nhận xuất xứ tại thời điểm làm thủ tục hải quan, nếu người khai hải quan không nộp thì hàng hóa không được thông quan và bị xử lý theo quy định của pháp luật